APU停车可有3种不同方法:正常停车是手动使主电门移到0FF位进行的;自动停车是APU控制组件因重要部件故障作动的;应急停车是由灭火手柄或各用紧急停车开关作动的。

正常停车冷却周期可从0120s(秒)变化,冷却周期后控制组件断开燃油。

自动停车命令是APU控制组件立即作动的,没有任何冷却周期。如果离心电门触发超转感应电路(通常为控制转速的110%),会切断向燃烧室的供油,使APU停车,此即超转停车。

如果滑油压力低于最小允许值,APU会自动停车。如果滑油温度高于允许值,APU会自动停车。

如果EGT超限,停止启动程序。大多数APU控制组件也监视启动程序期间的加速率,如果加速率太低,控制组件停止启动程序。因为在低速下工作时间长引起APU热应力高。

APU到达工作转速后,控制组件确保恒速和EGT不超限。APU控制组件使用转速信号和力矩马达信号控制恒速,通过改变力矩马达信号改变燃油计量实现。

APU有火警探测系统和灭火瓶。着火情况下,探测系统除了作动警告灯和警铃外还可以自动使APU停车。新型APU以及采用FADEC控制的APU在保护系统中还设置多重保护性停车。

例如,APU没有加速停车、没有转动停车、低速停车、没有火焰停车、传感器故障停车、进气过热停车、直流电源损失停车、没有EGT、转速信号停车等。

紧急停车开关是在地面人员容易接近的地方,如前起落架,主轮舱,或加油站。现代飞机当飞机在地面着火时,APU紧急停车自动进行,由专用的灭火系统自动熄灭。